Informace o projektu
Česká národní infrastruktura pro biologická data
(ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2015047
- Období řešení
- 1/2016 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
- RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- Mgr. Ivana Křenková
- Mgr. Slávek Licehammer
- RNDr. Michal Procházka, Ph.D.
- Mgr. Zdeněk Salvet
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves eleven institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Publikace
Počet publikací: 68
2019
-
Transhalogenation Catalysed by Haloalkane Dehalogenases Engineered to Stop Natural Pathway at Intermediate
ADVANCED SYNTHESIS & CATALYSIS, rok: 2019, ročník: 361, vydání: 11, DOI
-
ValTrendsDB: bringing Protein Data Bank validation information closer to the user
Bioinformatics, rok: 2019, ročník: 35, vydání: 24, DOI
-
ValTrendsDB: Database of biomacromolecular structure validation trends
Rok: 2019
2018
-
CalFitter: a web server for analysis of protein thermal denaturation data
Nucleic Acids Research, rok: 2018, ročník: 46, vydání: W1, DOI
-
CAVER Analyst 2.0: Analysis and Visualization of Channels and Tunnels in Protein Structures and Molecular Dynamics Trajectories
Bioinformatics, rok: 2018, ročník: 34, vydání: 20, DOI
-
Common ELIXIR Service for Researcher Authentication and Authorisation
F1000Research, rok: 2018, ročník: 7, vydání: 2018, DOI
-
Computer-assisted engineering of hyperstable fibroblast growth factor 2
Biotechnology and Bioengineering, rok: 2018, ročník: 115, vydání: 4, DOI
-
Evolutionary Analysis As a Powerful Complement to Energy Calculations for Protein Stabilization
ACS Catalysis, rok: 2018, ročník: 8, vydání: 10, DOI
-
Exploration of Enzyme Diversity by Integrating Bioinformatics with Expression Analysis and Biochemical Characterization
ACS Catalysis, rok: 2018, ročník: 8, vydání: 3, DOI
-
Gram-scale Production of Recombinant Microbial Enzymes in Shake Flasks
FEMS Microbiology Letters, rok: 2018, ročník: 365, vydání: 2, DOI