Informace o projektu
Česká národní infrastruktura pro biologická data
(ELIXIR-CZ)
- Kód projektu
- LM2015047
- Období řešení
- 1/2016 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Velké infrastruktury pro výzkum, vývoj a inovace
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- Mgr. Martin Prokop, Ph.D.
- RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.
- RNDr. David Sehnal, Ph.D.
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Ústav výpočetní techniky
- prof. RNDr. Luděk Matyska, CSc.
- Mgr. Ivana Křenková
- Mgr. Slávek Licehammer
- RNDr. Michal Procházka, Ph.D.
- Mgr. Zdeněk Salvet
- WWW stránky projektu
- https://www.elixir-czech.cz/
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba RNDr. Jiří Vondrášek, CSc.
Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Univerzita Karlova
Univerzita Palackého v Olomouci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze
Fakultní nemocnice U sv. Anny Brno
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Biotechnologický ústav AV ČR, v.v.i.
It is a current global trend that life science experiments generate an immense and steadily increasing volume of data. The Czech Republic feels this trend very strongly, because several new life science infrastructures were successfully established here, and they produce large amounts of data. It is necessary to store the data, safely manipulate with them, efficiently extract key information, etc. ELIXIR CZ is an infrastructure which is prepared to accept this challenge.
Thus, ELIXIR CZ aims to create a sustainable infrastructure for storing, processing and analysis of life science data in the Czech Republic. It will also provide tools and training that will facilitate performing these activities. Currently, ELIXIR CZ involves eleven institutions - nine life science research centres and two IT infrastructures. ELIXIR CZ also creates a communication platform for life science research institutes in the Czech Republic. ELIXIR CZ is a node of the European ESFRI project ELIXIR and is strongly involved in its activities. The ELIXIR project was approved by the Competitiveness Council from ESFRI as one of three prioritised Research Infrastructures.
Publikace
Počet publikací: 68
2021
-
Repeat proliferation and partial endoreplication jointly shape the patterns of genome size evolution in orchids
Plant Journal, rok: 2021, ročník: 107, vydání: 2, DOI
-
Stabilization of Haloalkane Dehalogenase Structure by Interfacial Interaction with Ionic Liquids
Crystals, rok: 2021, ročník: 11, vydání: 9, DOI
-
The tetrameric structure of the novel haloalkane dehalogenase DpaA from Paraglaciecola agarilytica NO2
Acta Crystallographica Section D: Structural Biology, rok: 2021, ročník: 77, vydání: March 2021, DOI
2020
-
A Haloalkane Dehalogenase from Saccharomonospora viridis Strain DSM 43017, a Compost Bacterium with Unusual Catalytic Residues, Unique (S)-Enantiopreference, and High Thermostability
Applied and Environmental Microbiology, rok: 2020, ročník: 86, vydání: 17, DOI
-
CaverDock: A Novel Method for the Fast Analysis of Ligand Transport
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, rok: 2020, ročník: 17, vydání: 5, DOI
-
Decoding the intricate network of molecular interactions of a hyperstable engineered biocatalyst
Chemical Science, rok: 2020, ročník: 11, vydání: 41, DOI
-
DockVis: Visual Analysis of Molecular Docking Trajectories
Computer Graphics Forum, rok: 2020, ročník: 39, vydání: 6, DOI
-
EnzymeMiner: automated mining of soluble enzymes with diverse structures, catalytic properties and stabilities
Nucleic acids research, rok: 2020, ročník: 48, vydání: W1, DOI
-
Genome Evolution in Arabideae Was Marked by Frequent Centromere Repositioning
The Plant Cell, rok: 2020, ročník: 32, vydání: 3, DOI
-
Machine Learning in Enzyme Engineering
ACS Catalysis, rok: 2020, ročník: 10, vydání: 2, DOI