Project information
Analýza interakcí mezi polyvalentním terapeutickým fágem druhu Twort-like a jeho hostitelem Staphylococcus aureus
- Project Identification
- GA18-13064S
- Project Period
- 1/2018 - 12/2020
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
- Mgr. Pavol Bárdy, Ph.D.
- Mgr. Tibor Botka, Ph.D.
- prof. RNDr. Jiří Doškař, CSc.
- Mgr. Adéla Finstrlová, Ph.D.
- Mgr. Vojtěch Kovařovic, Ph.D.
- Mgr. Ivana Mašlaňová, Ph.D.
Polyvalentní bakteriofágy druhu Twort-like jsou uznávány jako vhodné terapeutické agens proti stafylokokovým infekcím už od dob jejich objevu v 20. letech minulého století. Pro jejich terapeutické využití a schválení fágové terapie jako bezpečné metody, je nutná detailní znalost jejich molekulárně-biologického mechanismu infekce bakteriální buňky. Tyto fágy jsou předmětem intenzivního výzkumu, který se týká rozmezí hostitele, analýzy genomu a strukturních studií. V rámci předkládaného projektu navrhujeme monitorování průběhu fágové infekce hostitelských buněk pomocí analýzy transkriptomu, studia příčin fágové polyvalence, objasnění příčin rezistence některých kmenů k bakteriofágům a analýzu exprese fágových proteinů. V projektu budou použity metody sekvenování nové generace, kam patří RNAseq vhodná pro analýzu transkriptomu, molekulárně-biologické postupy jako transpozonová mutageneze a editace genomu. Výsledky projektu přispějí k popisu interakcí mezi fágem a hostitelem, jejichž porozumění je nezbytné před využitím fágové terapie.
Publications
Total number of publications: 19
2020
-
Rapid Isolation, Propagation, and Online Analysis of a Small Number of Therapeutic Staphylococcal Bacteriophages from a Complex Matrix
ACS Infectious Diseases, year: 2020, volume: 6, edition: 10, DOI
-
Structure and mechanism of DNA delivery of a gene transfer agent
Nature Communications, year: 2020, volume: 11, edition: 1, DOI
2019
-
Draft genome sequence of the Panton-Valentine leucocidin-producing Staphylococcus aureus Sequence Type 154 strain NRL 08/001, isolated from a fatal case of necrotizing pneumonia
Microbiology Resource Announcements, year: 2019, volume: 8, edition: 47, DOI
-
Future prospects of structural studies to advance our understanding of phage biology
Microbiology Australia, year: 2019, volume: 40, edition: 1, DOI
-
High genome variability within Kayvirus populations is key to improving their therapeutic efficacy against staphylococci
8th International Weigl Conference: HUMAN WELFARE AND INFECTIOUS DISEASES IN A NEW MICROBIOME RESEARCH ERA, year: 2019
-
Lytic and genomic properties of spontaneous host-range Kayvirus mutants prove their suitability for upgrading phage therapeutics against staphylococci
Scientific Reports, year: 2019, volume: 9, edition: 1, DOI
-
Staphylococcus petrasii diagnostics and its pathogenic potential enhanced by mobile genetic elements
International Journal of Medical Microbiology, year: 2019, volume: 309, edition: 8, DOI
2018
-
Description and comparative genomics of Macrococcus caseolyticus subsp. hominis subsp. nov., Macrococcus goetzii sp. nov., Macrococcus epidermidis sp. nov., and Macrococcus bohemicus sp. nov., novel macrococci from human clinical material with virulence potential and suspected uptake of foreign DNA by natural transformation
Frontiers in Microbiology, year: 2018, volume: 9, edition: 1178, DOI
-
Novel spontaneous mutants of bacteriophage 812 exhibit multiple genomic changes and increased lytic effect on MRSA strains
Year: 2018, type: Conference abstract