Project information
Characterization of mechanisms regulating transcription elongation and termination

Elongace je fáze transkripčního cyklu, během které dochází k prodlužování řetězce syntetizované RNA a posouvání transkripčního komplexu po délce genu. Elongační komplex (EC) spojený s RNA polymerázou II (RNAPII) je složen z mnoha proteinů, které jsou nezbytné pro efektivní přepis genu, a které se podílí na regulaci jednotlivých fází transkripčního cyklu. Aktivita mnoha těchto faktorů závisí na fosforylaci cyklin-dependentními kinázami (CDK). Mezi faktory EC a potenciální substráty cyklin-dependentní kinázy 12 (CDK12) patří protein SPT6, který během transkripce zajišťuje mimo jiné také translokaci histonů v chromatinu, čímž umožňuje přístup RNAPII k DNA. Jeho C-koncová doména obsahuje fosforylační místa, jejichž funkce zatím není známa. Objasnění mechanismu, jakým je elongační faktor SPT6 regulován, bude důležitým krokem k porozumění mechanismů regulace elongace a terminace transkripce.