Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Jak rostlinné transposony přispívají ke "genomové krajině" a organizaci interfázních jáder (transpozony)

Information

This project doesn't include Faculty of Science. It includes Faculty of Informatics. Official project website can be found on muni.cz.
Investor logo
Project Identification
GA21-00580S
Project Period
1/2021 - 7/2025
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Faculty of Informatics
Cooperating Organization
Institute of Biophysics
  • Responsible person doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.
  • Responsible person Ing. Pavel Jedlička, Ph.D.

Transpozony (transponovatelné elementy) představují významnou část rostlinných genomů, avšak jejich evoluční dynamika a vliv na fungování buňky stále zůstávají do značné míry nepochopeny. V rámci navrhovaného projektu budeme pomocí bioinformatických nástrojů i experimentálně studovat různé aspekty života transpozonů v rostlinných genomech - jejich věk, vlny amplifikací, strukturní rysy, inzerční preference, rozsah jejich genové konverze a ektopické rekombinace stejně jako vliv těchto procesů na genom. Množství a lokalizaci centromerických LTR retrotranspozonů u holocentrických chromozomů (celý chromozom funguje jako centroméra) porovnáme s příbuznými monocentrickými druhy. Pomocí moderní metody Hi-C budeme testovat potenciální vzájemné interakce transpozonů a jejich příspěvek k organizaci interfázního jádra. Naše výsledky přispějí k pochopení struktury, funkce a evoluce transpozonů. Porozumění jejich regulaci umožní ovlivňovat jejich aktivitu, což poskytne možnost zvýšení genetické variability, tolik potřebné při šlechtění plodin.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Sustainable Development Goal No. 1 – No poverty Sustainable Development Goal No. 3 – Good health and well-being Sustainable Development Goal No. 8 – Decent work and economic growth Sustainable Development Goal No. 9 – Industry, innovation and infrastructure

Publications

Total number of publications: 4

2023

2022

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.