Přijetí zásadní role a zodpovědnosti za kvality s sebou ve vnitřním prostředí univerzity přinese mnoho změn, přičemž se bude jednat především o poměrně rozsáhlé změny ve vnitřním fungování, zejména bude-li vysoká škola dle podmínek novely usilovat o získání tzv. institucionální akreditace. Přestože prvky zajišťování a hodnocení kvality jsou již dnes na vysokých školách v různé míře přítomny, zásadním úkolem bude jejich další rozvoj a dotvoření tak, aby působily jako fungující, účinný a současně i navenek transparentní systém. Zároveň se zdaleka nejedná o činnost jednorázovou, ale postupné vylaďování a zefektivňování, které bude muset projít několika fázemi.