Informace o projektu
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
- Kód projektu
- NV19-08-00250
- Období řešení
- 5/2019 - 12/2023
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu a vývoje na léta 2015 - 2022
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D.
- Mgr. Lucia Janáčová, Ph.D.
- Mgr. Petr Lapčík, Ph.D.
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Plzeň
- Odpovědná osoba prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
- Odpovědná osoba MUDr. Ondřej Fiala, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Alexandr Poprach, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Alice Hlobilková, Ph.D.
- Odpovědná osoba doc. MUDr. Radek Lakomý, Ph.D.
- Odpovědná osoba MUDr. Ján Podhorec
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.
Publikace
Počet publikací: 28
2022
-
Characterization of the AGR2 Interactome Uncovers New Players of Protein Disulfide Isomerase Network in Cancer Cells
Molecular & Cellular Proteomics, rok: 2022, ročník: 21, vydání: 2, DOI
-
Proteiny odpovědné za špatnou terapeutickou odpověď metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory
Rok: 2022, druh: Konferenční abstrakty
2021
-
A large-scale assay library for targeted protein quantification in renal cell carcinoma tissues
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
DIA-MS Identifies and Validates Transgelin as Protein Contributing to a Poor Response of Metastatic Renal Cell Carcinoma to Sunitinib Treatment
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
Proteotypová analýza renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
Rok: 2021, druh: Další prezentace na konferencích
-
SWATH-MS identifikácia stathminu ako potenciálneho markeru nádorov endometria u pacientok liečených tamoxifenom analýzou FFPE tkanív
Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
-
Transgelin Contributes to a Poor Response of Metastatic Renal Cell Carcinoma to Sunitinib Treatment
Biomedicines, rok: 2021, ročník: 9, vydání: 9, DOI
2020
-
Cytoreductive Nephrectomy and Overall Survival of Patients with Metastatic Renal Cell Carcinoma Treated with Targeted Therapy-Data from the National Renis Registry
Cancers, rok: 2020, ročník: 12, vydání: 10, DOI
-
Desmocollin-1 plays a role in breast cancer cell migration, invasion and metastasis and is modulated by parthenolide
Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
-
How Different Are the Molecular Mechanisms of Nodal and Distant Metastasis in Luminal A Breast Cancer?
Cancers, rok: 2020, ročník: 12, vydání: 9, DOI