Informace o projektu
Molekulární a cytogenetická analýza gigantických genomů rodu Fritillaria (Liliaceae)
- Kód projektu
- GA521/07/0284
- Období řešení
- 1/2007 - 12/2009
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc.
- Jarmila Neplechová
- RNDr. Dagmar Zachová
- Klíčová slova
- velikost genomu, repetitivní DNA, heterochromatin, komparativní genomika, molekulární fylogenetika
Rod Fritillaria zahrnuje rostlinné druhy s největšími známými genomy. Tento projekt si klade za cíl provést detailní molekulární a cytogenetickou studii repetitivních DNA sekvencí podílejících se na "genomové obezitě" a jeji variabilitě v tomto rodu. Naším cílem je zodpovědět následující otázky: (1) Jaká je variabilita velikosti genomu v rámci fylogenetických vztahů v rodu Fritillaria? (2) Vznikly tyto gigantické genomy následkem namnožení vysokého počtu různých rodin repetitivních elementů, anebo jsou z velké části tvořeny jen několika typy repetic amplikovanými do extrémně velkých počtů kopií? (3) Jak se podílí různé typy repetic na variabilitě velikosti genomu a na výrazných rozdílech v zastoupení heterochromatinu mezi jednotlivými druhy? (4) Jakou chromosomovou organizaci mají nejčetnější repetitivní elementy a jaká je spojitost mezi genomovou obezitou a stabilitou karyotypu? (5) Jaký je vztah mezi fylogenetickou příbuzností různých rodin repetic, fylogenetickými rekonstrukcemi v rámci rodu a taxonomickou klasifikací studovaných druhů?
Publikace
Počet publikací: 4
2011
-
Diverse retrotransposon families and an AT-rich satellite DNA revealed in giant genomes of Fritillaria lilies
Annals of Botany, rok: 2011, ročník: 107, vydání: 2, DOI
2009
-
Molecular and cytogenetic analysis of the biggest plant genomes
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
2008
-
Molecular analysis of repetitive elements in giant genomes of Fritillaria ( liliaceae)
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
2007
-
Punctuated genome size evolution in Liliaceae
J EVOLUTION BIOL, rok: 2007, ročník: 20, vydání: 6