Předmětem výzkumné činnosti je studium biodiverzity na úrovni populací a společenstev v různých časových a prostorových měřítcích, se zaměřením na interakce s abiotickým prostředím, interakce mezi organismy navzájem, historické a evoluční interpretace existujících struktur, identifikaci biotických indikátorů ekologických procesů a vývoj formalizovaných typologií společenstev a biotopů v terestrických, semiterestrických a vodních ekosystémech. Výzkum je zaměřen na modelové taxonomické a ekologické skupiny organismů napříč fylogenetickým systémem, jako jsou environmentální bakterie, cévnaté rostliny, bezobratlí živočichové včetně parazitů a obratlovci. Kromě tradičních oborově specifických metodik jsou při výzkumu využívány obecné metody molekulární genetiky, bioinformatiky, geoinformatiky, matematické statistiky a analytické chemie, vesměs zajišťované prostřednictvím integrovaných laboratoří.

Publikace