Informace o projektu
Studium lokální kontroly exprese genů pomocí spektrální mikroskopie a analýzy obrazu
- Kód projektu
- GA301/01/0186
- Období řešení
- 1/2001 - 1/2003
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Fakulta informatiky
- RNDr. Petr Mejzlík, Dr.
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Stanislav Kozubek, DrSc.
Užitím cytometrie s vysokým rozlišením jsme stanovili polohy několika genů, centromer a chromosomů v jádrech různých typů buněk a jejich změny v průběhu základních buněčných procesů jako je buněčný cyklus, diferenciace, reparace poškození apod. Také jsme zjistili, že změny v poloze genů mohou korelovat s utlumením genové exprese v průběhu diferenciace, což silně podporuje myšlenku, že struktura chromatinu představuje důležitý faktor pro regulaci exprese genů. v tomto projektu budeme studovat lokální str ukturu v těsné blízkosti genů a její vztah k expresi genů. Pro tento účel jsme vyvinuli techniku spektrální mikroskopie (SM), která nám umož·uje detekovat vzdálenosti genů pod 50 nm. Jako modelový příklad bude zkoumán globinový lokus: budou připraveny so ndy na LCR oblast a na oblast beta-globinu (značená odlišným fluorochromem), který se nachází na opačném konci celého lokusu, a jejich vzdálenosti budou změřeny ve fetální jaterní tkáni a v kostní dřeni dospělého jedince. Předpokládá se ( ale není to pro
Publikace
Počet publikací: 15
2004
-
Topographic characterization of telomeres in healthy and various tumor cell lines determined in situ and in vivo
Rok: 2004, druh: Konferenční abstrakty
2003
-
Architecture of chromosomal territories in apoptotic cells
Biophysics of the Genome, rok: 2003
-
Arrangement of chromosome 11 and 22 territories, EWSR1 and FLI-1 genes, and other genetic elements of these chromosomes in human lymphocytes and Ewing sarcoma cells
Human Genetics, rok: 2003, ročník: 112, vydání: 2
-
Cytogenetics and cytology of retinoblastomas
J Cancer Res. Clin.Oncol., rok: 2003, ročník: 129, vydání: 2
-
Chromosomal territory segmentation in apoptotic cells
Cellular and Molecular Life Sciences, rok: 2003, ročník: 60, vydání: 5
-
Nuclear and territorial topography of chromosome telomeres in human lymphocytes
Experimental Cell Research, rok: 2003, ročník: 289, vydání: 1
-
Topography of telomeres and structure of chromosome territories in human lymphocytes
Biophysics of the Genome, rok: 2003
2002
-
3D Structure of the human genome: Order in randomness
Chromosoma, rok: 2002, ročník: 111, vydání: 5
-
Nuclear structure and gene activity in human differentiated cells
Journal of Structural Biology, rok: 2002, ročník: 139, vydání: 2
-
Optimisation of FISH Methodology for the Study of 3D Structure of Cell Nuclei Using Micro Axial Tomography
Biophysics of the Genome and Its Interactions, rok: 2002